Når O-antigenpolymeren er forbundet med kernen af ​​lipid A, vil den stoppe polymerisationsreaktionen. Det vil sige, at forbindelsesreaktionen kan afslutte polymerisationsreaktionen. Både kernen af ​​lipid A og lipopolysaccharidet med gentagelsesenheder af forskellig længde kan effektivt overføres til den ydre membran. Derfor kan molekylstørrelsen af ​​lipopolysaccharid ses af SDS-PAGE, som er forårsaget af forskellen i biosyntesesystemet snarere end faktoren af ​​outputsystemet.

Fordelingen af ​​O-antigenets sidekæde i forskellige bakterier er forskellig, hvoraf nogle indeholder ca. 20 gentagne enheder, og nogle af dem kan være ca. 100 gentagne enheder. I SDS-PAGE-elektroforese afspejles forskellen i sølvfarvningsintensitet af forskellige molekyler af forskellige bakteriearter. Årsagen til den forskellige fordeling af sidekædelængden af ​​O-antigen i forskellige bakterier kan være, at der er en størrelsesudvælgelsesfaktor i processen med O-antigenpolykondensation eller forbindelsesreaktion. Wzz (dvs. Rol eller Cld) er et vigtigt protein, der regulerer fordelingen af ​​sidekædelængde i bakterier, der syntetiserer antigener via Wzy-afhængig vej, men dets specifikke mekanisme er stadig uklar.