De værtsmedierede systemer kan opdeles i celle- og humoralmedierede systemer. Førstnævnte henviser til neutrofiler, blodplader, monocytter, makrofager, lymfocytter, basofiler, mastceller, dendritiske celler og endotelceller; Kropsvæskesystemet er et komplement- og koagulationssystem. Endotoksin virker på det stammemedierede system. På den ene side spiller den sin forsvarsfunktion, på den anden side forårsager den også nogle patologiske processer.
1. Effekt på komplementsystemet
Endotoksinmolekyler på bakterier, frie endotoksinmolekyler og analoger af lipid A kan aktivere komplement, aktivere komplement på klassiske og alternative måder, spille en naturlig immunresponseffekt og sluge patogener og deres produkter; I processen med immunresponset kan det aktivere det erhvervede immunrespons, få en række forskellige cytokiner til at udtrykke og bringe gavnlige og negative virkninger til værten.
2. Effekt på blodkoagulationssystemet
Endotoksin kan påvirke kroppens blodkoagulationssystem, hvilket fører til forekomsten af dissemineret intravaskulær koagulation. Det er blevet bevist af dyremodeller, menneskekroppen og in vitro-forsøg, at endotoksin kan aktivere Hageman-faktor (koagulationsfaktor III, kontaktfaktor) og aktivere endogene koagulationsveje. På den anden side kan endotoksin også aktivere den eksogene koagulationsvej. Den prokoagulerende aktivitet af endotoksin er hovedsageligt manifesteret i lipid A. Efter at aktiviteten af endotoksin er inaktiveret af polymyxin B, forsvinder dets prokoagulerende virkning også.